层流手术室是采用空气洁净技术对微生物污染采取程度不同的控制，以达到控制空间环境中空气洁净度适于各类手术之要求；并提供适宜的温度、湿度，创造一个清新、洁净、舒适、细菌数低的手术空间环境，使病人在手术时组织受到尽可能少的损伤，并大大减低感染率，使病人术后能更快更好地恢复。所谓百级层流手术室，是指大于或等于0.5μm的尘粒数大于350粒/立方米(0.35粒/L)，小于或等于3500粒/立方米(3.5粒/L)；大于或等于5μm的尘粒数为0。

根据建设部《医院洁净手术部建筑技术规范》，层流手术室有高低之分，根据空气的洁净程度，分为五个等级，分别是：百级、千级、万级、十万级和三十万级，百级层流为最高级。